Nel 1995 fonda il suo studio e inizia a dedicarsi esclusivamente all’architettura organica contemporanea in terra cruda. Per la sua nuova casa studio sceglie un design arioso e fluido, lontano dall’idea di scatola chiusa tipica degli appartamenti ultramoderni del centro di Tokyo, che possa trasmettere nuovo benessere alla propria famiglia, reduce da una lunga malattia. Nella ristrutturazione della “Kanda SU/Nest House” impiega per la prima volta la tradizionale tecnica di intonacatura degli artigiani giapponesi di Sakan: il risultato trasforma una successione di spazi chiusi e senza vita in un ambiente accogliente e vibrante di energia positiva, capace di mutare nel tempo e rigenerarsi secondo la filosofia JINEN.

Nel 2000, durante l’inaugurazione della “nest=0″ a Londra, visitatori da diverse parti del mondo ritrovano in quella costruzione una tipologia familiare, mostrando che l’architettura di terra può toccare corde universali. Negli anni successivi si susseguono le commissioni: opere come “Red Container”, “Future House” e soprattutto “Shell House/ Il linguaggio della foresta”, la sua creazione più rappresentativa uniscono un design essenziale e unico ai benefici e al comfort dell’architettura di terra tradizionale. Per la sua capacità di spingere oltre il concetto di sostenibilità con l’uso di materiali organici e locali, e per aver liberato il fare costruttivo dalla schiavitù dei processi e delle componenti industriali, Tono Mirai riceve premi e riconoscimenti a livello internazionale, e partecipa a talk e convegni in Giappone e in Europa.